接下来的一段日子里，直树几乎每的大多数时间都是在宝可梦研究所中度过的。
首先是有关哲尔尼亚斯的研究，直树从哲尔尼亚斯口中了解到了神兽和普通宝可梦的区别。正常来现实和在游戏之中是一样，神兽的种族值比普通的宝可梦更加高一些，并不会展现出完全碾压的力量差距。
不过神兽拥有一种从外界提取力量的特殊能力，它们可以将能量储存在自己的身上，在战斗时拿出来使用。这种经过长时间积累的雄厚能量基本上不可能有普通的宝可梦能够凭借本身的力量匹担神兽会耗尽这种能量的唯一可能性就是遇到另一只敌对的神兽，并且双方使用这种能量对波。
哲尔尼亚斯和伊裴尔塔尔现在差不多都是将这股能量消耗到所剩无几的情况。
想要恢复这种能量的方法唯有重新来过，依靠时间的沉淀。
而哲尔尼亚斯这些似乎发现了新的方法，那就是从直树身上获取一些能量。在哲尔尼亚斯看来，mega进化的过程实际上就是宝可梦从训练家身上获得能量的过程，超进化手环和超进化石是这个过程的介质，而哲尔尼亚斯身为神兽不需要这个介质。
最关键的是直树服用了阿尔宙斯改造药水 乙型使得他拥有了近乎无穷无尽的能量，只要待在直树边上，哲尔尼亚斯就能比平时更快地累积能量。而且这个过程中还不用担心会对直树产生不好的影响。
虽然不是什么便捷的方法，但终归也是一件好事。至少在下一次遇到伊裴尔塔尔的时候，哲尔尼亚斯这边能够占据近乎绝对的优势。
完哲尔尼亚斯这边的事情，直树做的最主要的事情就是帮助布拉塔诺博士研究超进化，毕竟能够和多只宝可梦使用出超进化，直树可谓是卡洛斯第一人了，布拉塔诺博士毫不客气地就把直树拉过来当作工具人了。
至于为什么布拉塔诺博士会知道这个，纯粹是因为之前挑战映雪道馆的时候使用过被多罗巴看见了，然后多罗巴又告诉的布拉塔诺博士。
直树不知道布拉塔诺博士到底研究出来了个什么，反正他自己觉得超进化这个东西是挺玄学的，除了需要超进化手环和超进化石极其对应的宝可梦之外，直树也不准到底还有什么必要条件。大概真的就只能训练家与宝可梦之间的羁绊这类的东西了。
超进化对战系统在这个时候还只是刚刚起步，就算是联盟高层的人都还没能完全普及，直树挑战道馆的时候也就只有可尔妮和得抚两人拥有超进化手环和超进化石，四大王的话直树就不知道了，至少在游戏中他们是没有的。
正因为是刚刚起步，就算是直树这样云里雾里的法在布拉塔诺博士看来也是十分重要的经验。甚至直树还能在布拉塔诺博士新发表的论文之中占据一个署名的位置。
除了这些之外，直树自己本身也发表了自己作为一名研究助手的第一篇论文《性格对宝可梦能力和口味的影响》。这篇论文在佐藤彻和布拉塔诺博士的共同推动下名动一时，许多宝可梦训练家，尤其是宝可梦培育家都知晓了佐藤直树这个名字。
其实这篇论文算得上是游戏党或多或少都知道一些的东西，性格会影响宝可梦的能力，就比如固执的宝可梦比正常情况下物攻更高、特攻更低，获得物攻努力值更容易，获得特攻努力值更难。
至于性格影响口味的话大概只有尝试过华丽大赛玩法的人可能会有所了解，总的来的话就是攻击对应辣味，防御对应酸味，特攻对应涩味，特防对应苦味，速度对应甜味。同样以固执性格举例，固执性格的宝可梦通常来会更喜欢辣味，不喜欢涩味。当然这也不是绝对的，就比如直树的图图犬性格是爽朗，但是它并没有特别喜欢甜的东西，不过它确实不喜欢涩味。
随着时间一过去，佐藤彻有关哲尔尼亚斯的研究论文也出世了。这是宝可梦世界第一篇以传中的宝可梦为对象的研究论文，对于研究界的影响可想而知。
不过这也会导致一些潜在的威胁靠近。传中的宝可梦......总会有一些人会按捺不住的。像是某些无脑的宝可梦收藏家、唯利是图的宝可梦猎人，还有那些企图利用传宝可梦做一些大事的地下组织。
直树对此并不在意，这段日子直树也没有懈怠训练，宝可梦的等级也有了一些提升，外加有哲尔尼亚斯坐镇兜底，直树不认为自己有什么好过度担心的。最令人安心的就是服用了阿尔宙斯改造药水 乙型之后对身体强度的提升，直树现在就是堪比动画版之中智的存在，甚至还要更胜一筹，被喷射火焰、十万伏特之类的招式打中照样活蹦乱跳。所以直树完全不用担心会有人让宝可梦攻击自己。
等到佐藤彻的论文发布之后，直树打算出门特训一段时间，距离联盟大赛还有一些时间，直树不指望自己能拿第一，但不管怎么八强、十六强还是要有的。
......
“喂喂！老妈！你什么时候把图图犬给我传送回来啊！你那边的行程也该结束了吧！”
“放心好了，图图犬有我帮忙好好训练的，在今年联盟大赛之前会还给你的啦！”
“......”
“对了，直，你要不要来丰缘地区看看啊？在现场看一看妈妈的比赛？”
“算了，从卡洛斯地区到丰缘地区去太远了，而且夏的丰缘地区太热了，我不想去。”
“呵呵，水静市的海边可到处都是漂亮的比基尼大姐姐哦！”
“......了不去就是不去。”
“据德文公司有生产了新类型的精灵球哦！”
“没兴趣，如果是为了精灵球的话，我跑到城都地区去购买手工制作的特殊精灵球不是更好吗？”
“直你越来越没有意思了。”
“没事的话我就挂了，记得早点把图图犬传送回来！”
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