除了这个要求之外，赵志皋还要求严格官员铨选中的各种规则，大明原本也是有相应的制度的，其一、内外官员以姻亲回避。“洪武元年，令凡父、兄、伯、叔任两京堂上官，其弟、蘑子、侄有任科道官者，对品改调，近不拘对品，又令内外管属衙门官吏有系父子、兄弟、叔侄者，皆从卑回避”。
回避制度主要是针对两种情况，籍贯回避和科道回避，籍贯回避的问题是很简单的，就是为官必须回避本身，但是赵志皋认为，现在有冒籍的情况出现，并且冒籍在大明已经是一个很重要的情况了，所以赵志皋认为不仅仅要回避官员们的户籍，甚至对于本贯等也要予以回避，这样才能够保证乡党把持政权的情况出现。
而科道回避也是在大明实施很久的制度了，本朝对于在朝为官的亲属关系极为避讳，禁止在职为官的有亲属任职科道，六科给事中作为监察体系必须保持公正、公平。同为在朝为官的父子、兄弟、叔侄等，以辈分低者回避。亲族回避使得本朝很少出现同族在朝为官者，也就保证官员难以通过血缘结成亲密团体。
其二，外官以繁简互调。这体现出人尽其力的原则，对于能力高但任职地偏远和能力低但任职地复杂繁剧的官员酌情给予更换，不能很好治理地方的官员，暂时离职等待它用。
赵志皋认为这些本来都是朝廷的旧制，但是现在铨政上收，吏部不得行其事，内阁要重新执行这些回避制度，同时将各种回避重新予以制度，由吏部组织实施，同时就是常态化的对于官员的政绩予以考成和改调，这些权力必须要交给吏部。
赵志皋的意思其实是很明确的，吏部可以在京察大计之中对内阁和都察院作出让步，但是同样的，吏部尚书要加强自己对于吏部内部的权力，而且吏部在官员选任上的权力不能被干涉，这点也得到了王锡爵等饶支持，王锡爵的政治主张就是各司其职，
科道作为监察机关，就应该行使监察职能，不能过分染指行政权力，吏部负责铨选，就要有权力对于官员的升迁选任作出决定，这点是内阁所支持的。
白了，王锡爵所想要建立的行政体系，就是在内阁领导下的部院行政，皇帝将部分行政权力让渡给内阁，这样才能够保证内阁能够有足够的权力统帅部院，行政治国，而军事权力则牢牢掌握在皇帝手中，内阁只有建议权而不能直接干涉官军。
而在此之后内阁也奏请朱载坖，希望朱载坖能够圣驾亲临廷议，但是被朱载坖所拒绝了，朱载坖以圣躬不豫为由，令太子权同处分，主持廷议。
而王锡爵在之前已经和吏部、都察院等商量好了结果的，所以当的廷议并没有出现内阁和吏部、科道激烈对抗的局面，这是很多官员所没有想到，而对于王锡爵所拟定了京察大计新则，很多官员都是惊叹于王锡爵的狠辣，张居正搞出了考成法，已经让很多官员苦不堪言了。
但是王锡爵对于京察大计的改革就更是要命，王锡爵将京察大计的主导权交到了科道手中，对于在京察大计中被发现有贪墨行为，可能涉及触犯刑律的，是要直接送都察院法办的，这下使得京察大计的杀伤力直线上升，对于大明的这些官员们来，之前的京察当然也很可怕。
因为如果是在京察大计和之后的拾遗中被处以冠带闲住、罢职为民等处分的，是永不叙用的，但是对于大部分在京察大计中受到处分的官员们来，一般都是革职留任或者是降调等处分，这些处分对于这些官员们来其实还算是能够接受的。
但是现在根据王锡爵所拟定的京察新则来处分这些官员的话，一旦发现了涉及触犯刑律的行为，就不是吏部来处分了，而是都察院来处分了，这就使得这些官员极为担心了，降调什么他们并不怕，但是送都察院以刑律惩治那就是十分要命的事情了。
所以很多官员们都予以反对，认为此事过于严酷了，但是王锡爵在奏明朱载坖之后得到了朱载坖的支持，朱载坖当即御批同意，而且指令内阁领导此次京察大计。
而在朱载坖的支持之下，王锡爵以阁谕的形式明确指挥部院开始京察大计的各种准备措施，这点也是王锡爵和申时行的不同之处，申时行几乎是从不动用阁谕，一向都是以咨文的形式与各部院交流政务，但是王锡爵现在明确规定，内阁与各部院的公文往来，内阁必须使用阁谕。
这样就使得内阁和部院的上下级关系更加明确了，而且朱载坖还特地降旨，要求大明内外官吏，由贪墨者，在京察大计之前主动自首并且缴回贪赃所得的，以自首论，减三等处罚，不论死，而一旦在京察大计之中被发现的，如果不退缴赃款，加三等论，即便是退缴赃款，也需要加一等论。
同时在科道的建议之后，这次科道的咨访不仅仅局限于官员，对于吏员也同样允许咨访，准允吏员举报官员的贪赃枉法行为，而巡按御史只管发出访单，不准翻阅，收回访单之后，立即实封转交驻地锦衣亲军送达都察院，由都察院组织御史进行核查。
而在京察大计开始之后，朱载坖再次召见内阁辅臣，详细询问内阁下一步的计划，这也是朱载坖所关心的问题，上次朱载坖召见王锡爵，两人已经有所默契了，朱载坖对于王锡爵所采取的各项措施，也都予以了支持，这次朱载坖召见全体内阁辅臣，主要就是为了明确朝廷下一步的行政方向。
申时行执政的这些年，大明主要是以稳为主，基本上沿袭当年张居正的成法，因为大明一直在经略西域，战事不断，国内自然是以稳定为主了。
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