在王锡爵的两道奏疏一上，自然是立即在朝廷上引起了轩然大波，他们对于王锡爵的这个执政思路自然是极为不满的，现在本身就是朝廷大规模的大计，朝廷上下激烈斗争的时候，而且这次的一个新动向就是浙江官员和南直隶官员的斗争，在这个时候，王锡爵原本是应该低调上任，先安抚这些官员们，使得朝廷的政局先稳定下来，然后再推行自己的各种政策，而不是立即就将自己的观点亮明。
在申时行的府上，新旧两位首辅正在讨论接下来的朝局，申时行对王锡爵：“元驭啊，此事有些孟浪了！”申时行的就是王锡爵所上的两本奏疏，在申时行看来，王锡爵的这两本奏疏确实是在朝廷上下引起了极大的震撼，尤其是在科道言官当中，王锡爵本就和这些科道言官关系不好，这下更是使得他们极为不满的，对于王锡爵这个刚刚上任的首辅就心存敌意。
申时行在位的时候，对于这些科道言官还是相对比较和气的，基本上对于这些科道言官还是比较好处理的，在这种情况下，王锡爵一上任就对于科道开火，确实是一个很失策的问题。
对于申时行的劝阻，王锡爵不以为意，他对申时行道：“瑶泉公，你对科道百般庇护，此辈领情乎？只能以法绳之，昔日严分宜、徐华亭、高新郑、张江陵在时，比敢尔！”
对于王锡爵的这个看法，申时行不置可否，王锡爵的确实是实情，申时行这个首辅，虽然追求的事像李春芳那样和衷共济的想法，但是现在朝廷的现实情况和申时行的个人情况显然是和李春芳有所不同的，从权力上来，看似两者的权力是差不多的，但是实际上区别是很大的。
李春芳和申时行都是状元首辅，但是李春芳在嘉靖朝就长期担任裕王府讲官，和朱载坖的关系是极为亲密的，深受朱载坖的信任，申时行则是太子讲官出身，虽然也很受朱载坖的信任，但是在这个方面显然是然不足的，除此之外就是申时行和李春芳的个人势力问题。
李春芳是心学大佬，而申时行是南直隶官员的领袖，看似两饶实力是差不多的，但是实际上是有很大的区别的，李春芳是心学大佬，尤其是在徐阶致仕之后，李春芳更是成为当年大明心学的翘楚人物，在当年的心学官员之中，李春芳的地位是极为重要的，而且当时的心学官员内部也比较团结，能够为李春芳执政提供很强大的支持，而申时行看似是南直隶官员的领袖，支持申时行的官员数量看似是远远超过李春芳的。
但是实际上对于申时行来，这些官员对于他的支持力度是远远不如当年支持李春芳的那批心学官员的，这点申时行是很清楚的，所以尽管对于申时行来，看似他是很多的支持者，但是实际上对于申时行的，支持他的力量是远远不如当年对于李春芳的支持的。
所以尽管申时行也想像李春芳一样在朝廷上和衷共济，尽可能的团结的大多数的官员，但是实际上操作中，申时行远远达不到当年李春芳对于朝廷的掌握力度，很多时候申时行不得不依靠、拉拢言官群体来掌握朝廷，但是对于王锡爵来，他是无法做到的。
申时行依靠南直隶官员的支持和对于科道言官的拉拢，还是能够维持自己的首辅之位的，但是对于王锡爵来，此事就是完全不太可能了，因为对于王锡爵来，他本人和科道言官之间的关系就是极为不好的，在这种情况之下，现在浙江官员又和南直官员分道扬镳了之后，在这种情况下，王锡爵本人对于朝廷的掌握能力是显然不足的。
所以王锡爵很清楚，自己这个首辅，要想能够在朝廷之上站稳脚跟，不能够再采取申时行的这个办法的，王锡爵对于申时行对于这些科道的庇护也早有不满的，他们在严徐高张当首辅的时候，怎么不敢跳出来的？对于王锡爵来，他是希望能够当严徐高张这样大权独揽的首辅的，而不是继续申时行的路线。
对于自己这个同乡的志向是很了解的，申时行问道：“元驭以为首先应该怎么办？”
这点自然是现在王锡爵最紧要的事情了，王锡爵连上两疏，自然是将朝廷的火力都吸引到了自己身上了，但是现在王锡爵也必须拿出切实可行的办法来才行，所以王锡爵对申时行：“瑶泉公，止词讼、清狱囚，以法有司之怠缓，整肃朝廷之纲纪，正其时也。”
王锡爵的打算是很明显的，就是利用现在正在进行的大计，对于整顿朝廷现在的风气，以这次的大计，作为王锡爵推动自己政治理想的重要手段，对于王锡爵的这个想法，申时行还是有些担忧的。
申时行问道：“元驭可知道陛下为何要此时大计？”
有关这个问题，之前申时行也已经和王锡爵探讨过了，对于这次朱载坖突然宣布实施大计，再联系到朱载坖最近的一系列行为，申时行和王锡爵确实是对于朱载坖的目的有了一些了解，对于朱载坖来，正在逐步的向太子转移权力，这点是申时行和王锡爵都很清楚的事情。
所以申时行担心王锡爵在这个时候对于朝廷官员的整顿，会引发朝廷上下的震动，进而影响到朱载坖的部署，这点对于王锡爵地位的稳固是有很大的影响的，同时申时行也不得不提醒王锡爵，朱载坖之前就在辅臣面前提出过内禅的事情，而现在的种种情形证明朱载坖是在积极的准备此事了。
作为阁臣，必须要在这个问题上有非常鲜明的态度，不管是支持还是反对，阁臣都必须先坚定自己的立场，当时申时行是坚决反对内禅的，现在就轮到王锡爵来处理此事了。
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