程畿，字季然，巴西阆中人，刘璋割据益州时为汉昌长。巴西太守庞羲因刘璋猜疑而怀有叛离之心，命令程畿的儿子征召士兵自保，程畿不止制止儿子的行为，还服了庞羲，因此受到刘璋的赏识，被刘璋任命为江阳太守。赵云奉命入川攻打江阳时程畿投降，后来刘备取代刘璋担任益州牧，程畿担任从事祭酒。蜀汉建国后，程畿随刘备伐吴，刘备兵败夷陵后，程畿不肯撤退，奋力战死。
东汉末年，刘璋割据益州，程畿为汉昌长，巴西太守庞羲因下混乱，认为巴西郡应该有武装卫队，此时汉昌县分布有少数民族賨人，賨人为人刚猛，秦汉之际，汉高祖刘邦借助賨饶力量以平定关郑于是庞羲命令程畿大量征召賨人为私人军队，有人在刘璋面前陷害庞裟坏话，庞羲想要背叛刘璋，因此刘璋暗中怀疑庞羲，赵韪屡次劝告刘璋，刘璋不加理睬，赵韪也怀恨在心，于是反叛刘璋。
赵韪将刘璋围困于成都，东州兵和赵韪叛军力战，赵韪败徒江州，被杀。庞羲听这件事后十分害怕，将要谋求自守，于是，庞羲派遣程畿的儿子程郁，宣布旨令给程畿，索取賨兵自助。程畿告知庞羲：“本郡募集私人军队，本来不是为了叛变，虽然有人播弄是非，但还是需要表达自己的尽诚之心；若必然因为感到恐惧，于是怀有叛离之心，并非是我程畿所接受的。”并告诫程郁：“我受到一州的恩惠，应当为州牧竭尽忠诚和节义。你是郡吏，应当为太守效力，不可以认为我曾有叛离之心。”
庞羲遣人告诉程畿：“你的儿子在郡里，不服从郡太守的命令，因此你的家族将受到祸害！”程畿回答：“以前乐羊作为一个将领，喝了用他儿子的肉做成的汤，这不是父子之间没有情谊，而是因为君臣间的大义。如今，即使再次把我的儿子做成汤，我一定也会喝下去的。”庞羲知道程畿这样做必定不是为了自己，于是向刘璋表示表示深切的谢意，刘璋也宽恕了庞羲，在听程畿的事迹后，任命程畿为江阳太守。
刘备夺取益州，逐领益州牧，任命程畿为从事祭酒。程畿随先主刘备东征吴国，蜀军于夷陵遭遇败绩，沿长江顺流而下退军。有人告诉程畿：“后面的追兵已经赶上，抛弃船只，便可以逃脱。”程畿：“我在军中，未曾因为敌人弃船而走，何况跟随子而遇见危险呢！”不久之后，东吴水军追上了程畿，程畿手持大戟，与将士们一起与敌军爆发激战，并击沉了部分东吴战船，只可惜东吴水军主力赶到，将程畿团团包围，程畿力战而亡，但却为刘备摆脱敌军的追击赢得了宝贵的时间。
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