在联盟完成内部整合，准备妥当之后，一场精心策划的精准打击行动悄然拉开帷幕。
情报部门送回的情报显示，暗影议会在一颗偏远星球上建立了一个型武器研发中心，这里正在加紧研制一种能够突破联盟现有防御体系的新型导弹。若让其研发成功，联盟必将面临更大的危机。
远征军再次出征，不过这一次规模相对较，由一支精锐战舰编队和数支生物机甲特战队组成。他们凭借先进的隐形技术，神不知鬼不觉地靠近目标星球。
当抵达星球上空时，战舰编队立刻开启电磁静默模式，所有武器系统进入预热状态，蓄势待发。生物机甲特战队则乘坐型登陆艇，如鬼魅般穿梭于星球大气层，向着武器研发中心的坐标疾驰而去。
研发中心周围布满了防空炮和能量护盾，防御严密。但特战队早有准备，他们利用之前研发的反脉冲干扰器，干扰了防空炮的火控系统，使其陷入混乱，盲目射击。同时，战舰编队从高空发射超高频共振破盾炮，精准打击能量护盾的能量节点，几轮齐射之下，护盾泛起阵阵涟漪，最终轰然破碎。
趁着防御系统瘫痪，特战队迅速突入研发中心内部。里面的暗影议会成员惊恐万分，试图组织抵抗，但在训练有素的特战队面前，他们的反抗显得徒劳无力。
特战队一边清理残余敌人，一边由技术人员快速搜索并销毁关于新型导弹的研发资料和半成品。在激烈的交火声与设备的爆炸声中，关键数据被逐一删除，核心组件被强力摧毁，确保了这一危险武器无法现世。
战舰编队则在高空为特战队提供火力支援，拦截试图增援的敌方飞行器。光子裂变炮的光芒不时划破际，将来袭之敌炸成灰烬。
经过数时的激战，研发中心陷入一片火海，联盟远征军成功完成任务，全身而退。这次精准打击行动不仅摧毁了暗影议会的重要研发设施，还极大地打击了他们的士气，让他们意识到联盟依然具备强大的反击能力。
回到联盟后，远征军受到热烈欢迎，士气高涨。这一战果也让联盟内部更加团结，各方对后续的作战计划信心倍增。艾琳看着凯旋而归的将士们，心中明白，这只是漫长战争中的一个胜利，但它为联盟赢得了宝贵的喘息时间和战略主动，接下来必须乘胜追击，扩大战果，直至彻底消灭暗影议会。
然而，就在联盟沉浸在胜利喜悦之时，情报部门传来一个惊人消息。暗影议会竟在宇宙深处的一颗死寂星球上，秘密建造了一座巨型母巢。这座母巢正在孵化一种超巨型的生物战舰，其体型庞大到足以容纳数千架型战机，且拥有超强的能量护盾和火力系统。一旦成型，联盟现有的武器很难对其造成实质性伤害。艾琳立刻召集军事会议，商讨应对之策。经过激烈讨论，决定组建一支由最先进战舰和顶尖特战队员组成的敢死队，深入敌巢，在生物战舰孵化完成前将其摧毁。敢死队出发了，他们穿越危险的宇宙风暴带，躲过暗影议会的巡逻舰队，悄然接近母巢。当进入攻击范围，一场更为残酷的战斗即将打响，联盟能否再次凭借智慧和勇气化险为夷，彻底扭转战局，成为这场星际战争的最终赢家，一切还是未知数。
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