至南宋，神霄派在江南地区十分流校有称传自王文卿者，有称传自林灵素者，有称传自张继先者。虞集《正侍宸记》谓王文卿于南宋初飞升后，得其传者，唯新城高子羽，子羽传临江徐次举，次举传金溪聂锡，锡传临川谭悟真，人称谭五雷。入元后，谭悟真仍活动于人间。宋洪迈《夷坚丙志》卷十四云：建昌王文卿既以道术着名，其徒郑道士得其五雷法，往来筠、抚诸州，为人请雨治祟，召呼雷霆，若响若答。
南宋理宗时道士刘玉为《神霄金火丁大法》作《后序》，记有林灵素所传一系，称：“火师传与玉真教主林侍宸，林传与张如晦，后传陈道一，下付薛洞真，卢君野。次以神霄派脉付徐必大，徐亦不得其文，卢君化于剑江，将解，而枕中出其书以付玉。法传卢君，而派继徐君。”
《道法会元》卷二百五十三《地绪余论》又记张继先所传一系，称：“地一司之法，实起教于虚靖师，次显化于宝洞主王宗敬真官，青城吴道显真官，青州柳伯奇仙官，果州威惠钟明真人，相继而为宗师。其后如江、浙、闽、蜀、湖广，嗣法者何限，姓名昭揭宁几人。”以上所列诸饶事迹皆不详。
南宋时期的金丹派南宗亦兼传神霄五雷法。白云蟾《翠虚陈真让法记》称，火师汪真君命其弟子辛忠义传法给陈楠，陈楠传之白玉蟾。《海琼白真人语录》卷一曰：“真师告元长曰：……向者真遣狼牙猛吏雷部判官辛汉臣授之先师陈翠虚，翠虚以授于我，今以付子，子宜秘之。”《道法会元》卷一百四《高上景霄三五混合都大雷琅书》所列师派即为：玉清圣境元始法王，玉清真王长生大帝，……火师真君汪康民，辛忠义，陈楠，白玉蟾。《道法会元》卷八十三《先雷晶隐书》所列师派稍有不同，为：
李亚，汪守真，王文卿，白玉蟾、金逵……。明南五祖之陈楠、白玉蟾确系神霄雷法的重要传人。
由上可见，南宋时期传习神霄雷法的支派甚多，神霄派在当时传法颇盛。不仅如此，当时各个支派中又随时分衍出若干支系，使该派的传衍既盛且杂。《道法会元》卷二百五十三《地绪余论》称，起于虚靖师的地*一法，传至后来，“则有苏道济派，温州正派，李蓬头派，遇矅卿派，玄灵续派。如慈类，数之不尽。千蹊万径，源析之分，使学者莫之适从。”明张宇初：“神霄则雷霆诸派始于玉清真王，而火师汪真君阐之。次而侍宸王君、虚静真君、西河萨君、伏魔李君、枢相许君。倡其宗者，林灵素、徐神翁、刘混康、雷默庵、万五雷、方贫乐、邓铁岩；而上官、徐、谭、杨、陈、唐、莫而下，派亦衍矣。”又称“神霄自汪、王二师而下，则有张、李、白、萨、潘、杨、唐、莫诸师，恢弘犹至。凡雷、酆岳之文，各相师授，或一将而数派不同，或一派而符咒亦异，以是讹舛失真，隐真出伪者多，因而互生谤惑。”可见神霄派在南宋时期传播十分繁盛，但也十分杂乱。
入元以后，传林灵素、张继先者转衰，传王文卿者较盛。
其主要传人为莫月鼎。吴兴人。约生于南宋理宗宝庆年间，飞升于明成祖至明末。初从四川青城山丈人观徐无极受五雷法，继闻邹铁壁得王文卿斩勘雷书，秘不传，乃委身童隶事之，终获受其书。于是“召雷雨，破鬼魅，动与合。
虽嬉笑怒骂，皆若有神物从之者”。明成祖曾召见试其术“有验”，有旨令掌道教事，以老耄辞，遂给驿南旋。此后，佯狂避世，浪迹江湖。莫月鼎之弟子甚众，但所得王文卿之秘籍，一如邹铁壁，不轻易授人，因疵其真传者，唯王继华与潘无涯二人。后“继华授张善渊，善渊授步宗浩，宗浩授周玄真。皆解狎雷致雨云，而玄真尤号伟特”。周玄真，字玄初，世居嘉禾，后迁姑苏。从步宗浩受五雷秘文后，祈雨治疾，颇有奇验，享誉于宋末之际，明初飞升。前引虞集《灵惠冲虚通妙真君王侍宸记》又记王文卿所传高子羽一系，传至谭悟真时，已由宋入明。后谭悟真传庐陵罗虚舟，虚舟再传萧雨轩、周立礼二人。周传其子，萧则传胡道玄。道玄，鄱阳人，人称“神霄野客”，行道于关、陕、荆、襄、江、汉、淮、海、闽、浙之间。此外，又有金善信，字实之，吴之长洲人，曾得莫月鼎不传之秘，被三十八代师张与材起为广德路道录，明室赐号体仁守正弘道法师。
还有王惟一亦传莫月鼎之学。王惟一，号景阳子，括苍人。
其所着《道法心传》称，曾得莫月鼎和邹铁壁之秘法。该书对雷法多所阐扬。
明代神霄派除莫月鼎一系十分昌盛外，还有其他一些支系同时活动。《历世真仙体道通鉴续编·莫月鼎传》云：莫月鼎“与同郡西野沈震雷真人同师事铁壁邹真人”。“自侍宸王真君演道以来，惟真人与西野沈真人二派支流衍迤，盛于西江，昌于东吴。”即莫、沈两系皆分别传衍于苏、浙、赣、闽、广等地。唯沈震雷一系不见其他记载，故未得其详。
入明以后，仍有神霄道士的活动。除前述莫月鼎一系传至周玄真，享誉于宋明之际外，又有周思得显名于永乐间。据钱谦益《列朝诗集》载，周思得，字养真，钱塘人。“行灵官法，先知祸福。文皇帝北征，召扈从，数试之不爽。招弭祓除，祈雨禬兵，咸如影响。乃命祀灵官神于宫城西，……思得历事五朝，年逾九十，赐谥弘道真人”。
据《万历野获补遗》卷四和《明史·礼志》载，周思得所行灵官法，是萨守坚弟子王灵官传下的。因周思得行之有验，成祖乃封萨守坚为崇恩真君，王灵宫为隆恩真君，并建庙祀之。此后传奉萨守坚道法的道士，继续传行，称“西河派”，或“山派”，其详无考。
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