认为通过存思，地之神可以进入人体，人体之神与地之神混融，即可长生不老，飞登上清。上清派的存思、服气、咽津、念咒、佩符等修持方法，对道教斋醮仪式影响甚大。
《上清大洞真经》：简称《大洞真经》、《洞经》或《三十九章经》，上清派最早崇奉的主要经典，谓读之万遍即可成仙，被誉为“仙道之至经”。此经被上清派奉为诸经之首，比较典型地反映了上清派的修习方术。全书三十九章，以歌诀形式叙述存神法。此经在唐宋以前影响很大，后因内丹术之兴起，影响渐衰。但经中的穴位名称及气血津液、人体结构观念，多与传统医学相通，对研究道教的养生气功有重要的参考意义。
《黄庭经》：上清派崇奉的另一重要经典，是一部以华夏医学脏腑学为理论基础，认为人体百脉关窍各有主神，需用“存思”法以存守身神的修炼专着。《黄庭经》是前代修炼养生经验的总结，又为后世的内修提供了基本理论和方法，被称为“寿世长生之妙典”。
《上清大洞真经》是《上清经》的首卷，最早由南岳魏华存传给东晋句容人杨羲，后者于晋兴宁二年用隶书将经卷写出后传给许谧、许翙。二人在原经文基础上，进一步扩大经文篇幅，使得经文广为流传。北宋陈景元的《上清大洞真经玉诀音义》为《大洞真经》的代表性校释本。《上清大洞真经》被视为道家“三奇第一之奇”，上清派奉此经为上清诸经之首，宣称得到经书的人，可以不用修炼金丹，只需将这本经书读万遍即可成仙。此经经文名中的“大洞”为上清家理想仙境，据称此经本藏于大洞仙宫中，故名《大洞真经》。
第一卷为诵经玉诀，述修炼者诵咏《大洞真经》三十九章之前的存思礼仪，着重存思五方之气、日月及二十四星。第二至第六卷为三十九章经，每章存思一神降临修炼者身中某一部位，默念祝咒，存呼神名，祈请其护卫。这是典型的道教上清派炼养方法，是《黄庭经》的延伸，对我们研究上清经系、上清派历史及道教炼养学都有一定的意义。收入《正统道藏》洞真部本文类。
上清有三十九帝皇，大道佣三十九章经》，饶身体中有三十九种部位，修炼若存思每章经之一神，神就能降临保护修炼者的某一部位，“开生门”，“塞死户”，这样闭斋诵读万遍，就可以“乘云驾龙，即日升”，跻身于虚幻仙境。朱校本分经为六卷。该经第一卷为《诵经玉诀》，讲述修炼者在进斋室入定诵咏《大洞真经》三十九章之前的整套存思礼仪，包括叩齿、咽津、孝存思和咒祝，还记佣入室存思之图》。存思包括三个方面内容：首为存思五方之。五方指东南西北中五个不同的空间方位，即为气。存思五方之的具体过程较复杂，其基本思想是以东南西北中五方为基础，配以五孝五色、五脏的相应变化。
大致过程是，修炼者先分别朝东西南北中五方静心闭目叩击牙齿，默诵用于五方不同的咒语分别为《太帝君素语内咒》、《帝君素语内咒》、《南极上元君素语内咒》、《后圣帝君素语内咒》、《太微帝君素语内咒》，五方之颜色分别为青、赤、白、黑、黄。再分别引若干次，口咽唾液，让精气分别充入人身中肝、心、肺、肾、脾五脏，结成状如木星、火星、金星、水星、土星之神。这种五方坛式结构方式，明显受阴阳五行学术的影响，并与古灵宝《五篇真文》和《五符序》近似。其次为存思日月，主要内容是：“口及日月一息，分三九咽，结作二十七帝君”，其职九帝不入绛宫，穿尾闾穴，上入泥丸；又九帝亦下穿绛宫，入下关之境；又九帝九中关之境。令日光使照一身，内彻泥丸，下照五脏肠胃之中，皆觉洞照于内外，令一身与日月之光合。
良久，叩齿，用‘嘻’字吐息。”其三，为存思二十四星，“此法每日行住坐卧，皆可修之。”主要过程是：“口吸二十四星一息，咽津二十四过，时觉吞一星从口中径至脐中，又觉星光映照于一腹之内，洞彻五脏，又存星光化为二十四真人，并口吐黄如烟，以布脐中，郁郁然洞彻内外，良久，用‘呼’字吐息。”可见这些存思方法，充满神奇的想象，对后世的气功学有一定影响。
该经的卷二至卷六的三十九章经详细地介绍修炼者存思的具体过程，每章分别记载神的名字和所镇守的人身部位及其功能。修炼者在默诵具体章经时，先谨请某种神，再“真思”该神降生的不同颜色的真为神云罩在修炼者的头上；接着“次思”此神云从泥丸中入，乃口吸神云，吞津若干次，则真结成数神，在人体内运行，通过具体的关窍，达到神所镇守的部位，然后修炼者咏硕大洞玉经》，默念咒祝，想象佩带各神的“消魔玉符”，“存呼”神的名字，请其发挥护卫功能，这便是每章经存思的大致过程。在三十九章之后，还有结经《徊风混合帝一秘诀》，指出修炼者在诵咏三十九章经之后，便应闭目存思这众神白气，混沌一团如白云，从云虚中来入口中，良久，从玉茎、两脚底、两手心中出去了良久，白忽又变成紫云，从口入头并入五脏之内，充满腹内，过了较长时间，紫云从两脚底、两手心、玉茎中透出；过一会儿，存见紫云之充满左右及一室之内，又想象口中出风吹紫云之烟，互相混合缠绕，忽然结一位称作“大洞帝一尊君”的仙；尊君嘴的左边有日光，嘴的右边有月光，嘴里吐着徊风之，吹着日月之光，都变成白色和紫色之气，让光下渗入修炼者五脏六腑百节之内，一身之内，洞彻朗然，内外如白日那样明亮，过了较久，忽然忘身，诸事完毕，神己定，觉得身体轻巧、神清气爽，接着叩齿三十九遍，两手试面，再念颂咒，心拜四方，乃起，至此，三十九章存思的整个过程，始告结束。
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