有了皇帝赵璟这面“旗帜”，以及信王妃暗中联络的、早已对太后外戚专权不满的朝臣武将，反击的力量迅速凝聚。
药婆的残方提供了“双生花”药性的一些线索，虽然不足以完全复制，但足以作为指控太后和元后当年行径的有力佐证。安公公秘窟中的部分信件和账目，则隐约指向太后通过这些隐秘手段，操控前朝后宫，甚至与江南“药人”事件可能存在的关联。
皇帝被“释放”出宗人府，重归金銮殿。他的回归，本身就是一个强烈的信号。
他没有立刻发作，而是隐忍不发，暗中调动信王妃和盟友提供的势力，利用太后一党尚未完全反应过来的时间差，以雷霆之势，首先清洗了宫廷禁军和京城防务的关键岗位，换上了相对可靠或至少中立的人。
太后起初并未将皇帝的“不安分”放在眼里，在她看来，这个由她一手扶持起来的孙子，掀不起太大风浪。直到她安插在皇帝身边的眼线被一个个拔除，直到她发现自己的政令在朝堂上开始受到公开质疑和抵制，直到江南沈墨那边传来消息失去了对阿阮和信王妃的掌控……
她终于意识到，局面正在失控。
而给予太后势力致命一击的，是在一次大朝会上。皇帝赵璟，在几位重臣的配合下，突然发难！他没有直接提及“双生花”和身世，那太过惊世骇俗。他选择了一个更“冠冕堂皇”的切入点——江南织造局督办沈墨，勾结漠北水匪（水鬼），私造禁药，意图不轨！而沈墨，是太后的亲侄孙，是太后一手提拔起来的心腹！
一石激起千层浪！
紧接着，一系列关于沈墨贪腐、结党营私、甚至暗中进行禁忌人体试验的“确凿证据”被抛了出来。朝堂大哗！太后一系的官员拼命辩解，但皇帝准备充分，人证物证链相对完整，又有军方势力隐隐支持皇帝，形势一面倒。
太后在慈宁宫听闻消息，惊怒交加，她没想到皇帝敢如此直接地撕破脸，更没想到他掌握了这么多关于江南之事的证据！
她立刻下令调派自己掌控的京营兵马入宫“护驾”，企图武力控制皇宫，做最后一搏。
然而，她的命令未能传出宫门。信王妃和阿阮，带着一部分反正的禁军和江湖好手，早已暗中控制了宫禁要道。
最终的对抗，在太后的慈宁宫前展开。
太后身着凤袍，头戴珠冠，在一群死忠太监和宫女的护卫下，站在宫门前，面对着手持兵娶步步紧逼的皇帝、信王妃和阿阮等人。
她保养得夷脸上此刻布满寒霜，眼神阴鸷地盯着皇帝：“璟儿，你可知你在做什么？没有哀家，哪有你的今日！”
赵璟脸上再无平日的温顺，只有冰冷的恨意：“母后？不，您只是把朕当成一件工具的仇人！朕今日，是来拿回本该属于朕的东西！”
“属于你？”太后嗤笑，目光转向阿阮，带着极度的厌恶，“就凭这个来历不明的野种，和那个睿王府的余孽？”
信王妃长剑一指，厉声道：“老妖婆！死到临头，还敢口出恶言！你为了权力，构陷忠良，毒杀亲王，连自己的女儿和外孙都当作棋子玩弄，你还有何人性可言！”
太后闻言，却忽然仰大笑起来，笑声中充满了疯狂与不甘：“人性？权力就是最好的人性！哀家年少入宫，从卑贱的才人爬上来，受了多少屈辱！先帝眼里只有那个贱人！朝堂之上，那些男人何曾正眼看过我们这些后宫女子？哀家不服！凭什么女子就不能执掌自己的命运，不能掌控这下？”
她的眼神变得偏执而狂热：“没错！‘双生花’是哀家找来的！计划是哀家定的！文家必须死！睿亲王必须死！所有挡路的人都得死！哀家就是要让这赵家的江山，实际姓哀家的姓！皇帝不行，就换一个！血脉？呵呵，能被制造出来的东西，算什么血脉！哀家就是！”
这疯狂的自白，彻底坐实了她的罪行，也寒了所有在场饶心。
“拿下！”皇帝赵璟再无犹豫，厉声下令。
混战爆发。太后的死忠做着困兽之斗，但大势已去。
最终，慈宁宫的血迹被清洗干净，太后被废去尊号，打入冷宫最深处，严加看管，等待她的将是永无止境的黑暗囚禁。
持续数十年的“双生花”阴影，似乎在这一刻，随着旧日权力核心的崩塌，而渐渐散去。
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